查找感兴趣的通路图（二）：KEGG数据库

姜呈全

KEGG【Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，京都基因与基因组百科全书】是一个整合了基因组、化学和系统功能信息的综合性数据库，旨在揭示生命现象的遗传物质与化学蓝图。

KEGG 数据库链接：https://www.kegg.jp/





接下来将以HIF为例演示如何从KEGG数据库找到想要的通路

1 、主页面搜索框中输入 HIF，点击 Search



出现如下界面



2、 点击 KEGG PATHYWAY 下方的 map04066 进入 HIF-1 signaling pathway



出现如下界面



Entry、Name、Description、Class 为该通路的基本信息，其中Description 为 HIF-1 信号通路总体的描述。



Pathway map 即为通路图，点击即可查看 HIF-1 信号通路图





Reference、Authors、Title、Journal 为该通路图的参考文献信息



Related pathway 即为相关通路，点击可以查看与 HIF-1 信号通路相关的通路图。

KO pathway 即为 KO 通路，点击可以查看 HIF-1 KO 表现形式的通路图。



3、 进入通路图后点击 Change pathway type 可以对物种进行选择



点击后出现如下界面



4、 在Organism specific 下方选择目标物种，点击目标物种蓝色简写即可进入该物种的 HIF-1 信号通路图（以人为例）



出现如下界面即为人的HIF-1 信号通路图



（点击）推荐阅读：查找感兴趣的通路图（一）：Wiki pathways数据库

实验技能分享：
科研日精进：实验笔记丨采用InsightII软件进行分子对接
实验笔记丨Bottom-up 蛋白质谱样品制备
科研日精进：​几种最新预测蛋白质相互作用模型的方法
实验笔记丨流式细胞法检测病毒滴度
实验笔记丨逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR，rtpcr）步骤详解
实验笔记丨Trizol法提取总RNA步骤详解
实验笔记丨RNA 干扰（RNAi）实验步骤详解
科研日精进：实验笔记 | mRNA分离纯化的步骤详解
实验笔记丨实时荧光定量PCR步骤详解
实验笔记丨流式检测细胞凋亡之Annexin V 检测细胞凋亡
毕氏酵母（Pichia pastoris）感受态细胞制备及转化
实验笔记丨过氧化物酶标记测定法检测细胞凋亡
实验笔记丨CAR-T细胞毒性实验步骤详解
实验笔记丨CRISPR-dCas9实验步骤详解
实验笔记丨细胞转染操作详细步骤及各方法比较
实验笔记丨大肠杆菌转化实验（热击法）
实验笔记丨大肠杆菌感受态细胞制备实验（CaCl2 法）
实验笔记丨免疫细胞的分离、纯化和鉴定
实验笔记丨CAR T细胞活化水平以及增殖能力的检测
实验笔记丨Native PAGE 的步骤详解和注意事项
实验笔记丨病毒感染细胞实验的步骤详解（下卷）
实验笔记丨病毒感染细胞实验的步骤详解（上卷）
实验笔记丨B 淋巴细胞分离技术
实验笔记丨贴壁细胞的培养及转染
实验笔记丨蛋白质的表达、分离、纯化实验
实验笔记丨siRNA 表达载体的构建步骤详解和注意事项
实验笔记丨Transwell实验检测细胞侵袭能力
实验笔记丨SSR 分子标记实验的步骤详解和注意事项
实验笔记丨分子标记技术AFLP的步骤详解和注意事项
实验笔记丨荧光原位杂交实验（FISH）步骤详解和注意事项
实验笔记丨流式细胞仪样品制备的步骤详解和注意事项
实验笔记丨Southern Blot 步骤详解和注意事项
实验笔记丨​Northern Blot 步骤详解和注意事项
实验笔记丨重组质粒的连接、转化及筛选
2D电泳超详细的protocol，非常的哇塞！
不能更详细！染色质免疫共沉淀（ChIP）实验方法
实验笔记丨Far western blotting实验步骤和重点考虑因素
科研日精进：实验笔记丨“圆二色光谱”实验方法和注意事项
科研日精进：实验笔记丨ELISA实验，你真的学废了吗？
科研日精进：实验笔记丨病毒滴度及生长曲线测定
科研日精进：实验笔记丨分子间相互作用分析——微量热泳动（MST）技术介绍
科研日精进：实验笔记丨免疫荧光细胞样品制备
科研日精进：实验笔记丨双荧光素酶报告基因验证法
科研日精进：实验笔记丨外源基因的原核表达及蛋白检测
科研日精进：实验技能丨2种常用的蛋白纯化的方法
科研日精进：实验技能丨酵母双杂交实验超详细protocol
科研日精进：实验技能丨免疫共沉淀的原理与方法
科研日精进：实验技能丨双分子荧光互补-BiFC技术详解
科研日精进：实验技能丨四个蛋白质分子对接在线工具
科研日精进：实验技能丨四个蛋白质序列分析在线工具
科研日精进：关于DNA定点突变的两种方法
科研日精进：Western Blotting实验中常见问题及解决方案
科研日精进：Western Blotting技术之转膜
科研日精进：Western Blotting技术之样品制备
科研日精进：Western Blotting技术之免疫检测
科研日精进：Western Blotting技术之免疫检测
科研日精进：Western Blotting技术之电泳

更多科研实验干货，请关注“科研日精进”VX公众号